Zwischen gefluteten und Rieselfiltern gibt es einen großen Unterschied in Bezug auf das eingesetzte Filtermaterial.
Der Unterschied zwischen gefluteten Filtern und Rieselfiltern ist der, dass in gefluteten Filtern das Wasser in der Regel langsam hindurchströmt und sich das Filtermaterial permanent unter Wasser befindet. In Rieselfiltern dagegen befindet sich das Filtermaterial an der Luft und das zu filternde Material prasselt, beziehungsweise rieselt, hindurch. Daraus ergibt sich für die Praxis ein wichtiger Unterschied: Wo das Material in gefluteten Filtern aufgrund der meist geringen Strömung und des fehlenden Drucks immer die Tendenz zum verstopfen hat, wird es in Rieselfiltern permanent frei gespült. Aus diesem Grund können in Rieselfiltern Materialien mit feineren Strukturen eingesetzt werden als in gefluteten. Und feinere Strukturen haben in der Regel meist eine höhere Oberfläche, was am Ende nichts anderes ist, als eine größere Ansiedlungsfläche für Bakterien.